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动力蛋白样120kDa蛋白,线粒体亚基2突变及应用

2021-03-05 05:39:06

动力蛋白样120kDa蛋白,线粒体亚基2突变及应用

  技术领域

  本发明涉及一种基因工程领域,尤其涉及动力蛋白样120kDa蛋白,线粒体亚基2突变及应用。

  背景技术

  动力蛋白样120kDa蛋白,线粒体亚基2(dynamin-like 120kDa protein,mitochondrial isoform 2)是哺乳动物动力素样蛋白(DLP1),是线粒体的正常细胞分布和培养细胞内质网层所必不可少的。

  人的动力蛋白样120kDa蛋白,线粒体亚基2发生突变会对人类健康造成严重影响。在对某些神经退行性疾病患者的外周血进行基因测序的过程中,均发现患者的动力蛋白样120kDa蛋白,线粒体亚基2发生了突变,因此,对人的动力蛋白样120kDa蛋白,线粒体亚基2突变的检测对判断人体是否患有相关疾病具有一定的指引作用。

  发明内容

  本发明目的在于提供动力蛋白样120kDa蛋白,线粒体亚基2突变及应用。

  本发明技术方案包括:

  第一方面,提供一种人的动力蛋白样120kDa蛋白,线粒体亚基2突变蛋白,其氨基酸序列如SEQ ID NO:1所示。

  第二方面,提供一种人的动力蛋白样120kDa蛋白,线粒体亚基2突变蛋白的编码基因,其核苷酸序列如SEQ ID NO:2所示。

  第三方面,提供一种基因芯片,包括:固相载体和固定在该载体上的核苷酸探针;所述核苷酸探针根据上述所述人的动力蛋白样120kDa蛋白,线粒体亚基2突变蛋白的核苷酸序列,与人的动力蛋白样120kDa蛋白,线粒体亚基2正常蛋白的核苷酸序列的比对结果确定。

  优选地,所述核苷酸探针为SEQ ID NO:3所示的碱基序列;

  或,所述核苷酸探针为SEQ ID NO:4所示的碱基序列;

  或,所述核苷酸探针为SEQ ID NO:5所示的碱基序列。

  第四方面,提供一种试剂,所述试剂中含有用于检测上述人的动力蛋白样120kDa蛋白,线粒体亚基2突变蛋白的引物对。

  优选地,其所述引物对包括下述上游引物与下述任一下游引物的组合:上游引物为如SEQ ID NO:8所示的碱基序列;下游引物为如SEQ ID NO:19~NO:40中任一所示的碱基序列;

  或,

  其所述引物对包括下述任一上游引物与下述任一下游引物的组合:上游引物为如SEQ ID NO:8-NO:18所示的碱基序列;下游引物为如SEQ ID NO:29~NO:40中任一所示的碱基序列。

  第五方面,提供一种特异性识别人的动力蛋白样120kDa蛋白,线粒体亚基2突变蛋白的单克隆抗体,由上述试剂制备而成,其可与SEQ ID NO:1所示的氨基酸序列特异性结合。

  第六方面,提供一种用于检测人的动力蛋白样120kDa蛋白,线粒体亚基2突变蛋白的ELISA试剂盒,所述ELISA试剂盒包括:包被有上述单克隆抗体的ELISA酶标板、酶标二抗、样品稀释液、包被缓冲液、ELISA酶标板洗涤液、显色液和终止液。

  优选地,所述酶标二抗为稀释的HRP辣根过氧化物酶标记的山羊抗人IgG。

  本发明提供了动力蛋白样120kDa蛋白,线粒体亚基2突变及应用,将大量神经退行性疾病患者作为研究病例,对病例进行基因检测并分析,确定出人的动力蛋白样120kDa蛋白,线粒体亚基2的突变蛋白,根据该人的动力蛋白样120kDa蛋白,线粒体亚基2突变蛋白制备基因芯片、单克隆抗体和ELISA试剂盒,为神经退行性疾病的基因诊断提供指引作用,为疾病的诊断和治疗提供一定的理论基础。

  上述说明仅是本发明技术方案的概述,为了能够更清楚了解本发明的技术手段,并可依照说明书的内容予以实施,以下以本发明的较佳实施例并配合附图详细说明如后。

  附图说明

  图1是本发明实施例一提供的一种比对结果示意图;

  图2是本发明实施例一提供的一种基因芯片布局图;

  图3是本发明实施例二提供的一种显色结果示意图;

  图4是本发明实施例二提供的另一种显色结果示意图;

  图5是本发明实施例五提供的为蛋白含量的标准曲线;

  图6是本发明实施例五提供的Western blot检测结果示意图。

  具体实施方式

  下述实施例中所使用的实验方法如无特殊说明,均为常规方法。

  下述实施例中所用的材料、试剂等,如无特殊说明,均可从商业途径得到。

  实施例一、基因芯片的制备

  首先,可以根据申请号为“201710429915.8”、专利名称为“一种突变蛋白的检测方法及装置”的中国发明专利中描述的检测方法,确定出人的动力蛋白样120kDa蛋白,线粒体亚基2突变蛋白的编码基因,其核苷酸序列如SEQ ID NO:2所示;相应地,根据该编码基因确定出人的动力蛋白样120kDa蛋白,线粒体亚基2突变蛋白,其氨基酸序列如SEQ ID NO:1所示。

  其次,根据人的动力蛋白样120kDa蛋白,线粒体亚基2突变蛋白及其编码基因,按照如下方式实现基因芯片的制备。

  1、核苷酸探针的设计

  (1)核苷酸探针的设计:核苷酸探针根据人的动力蛋白样120kDa蛋白,线粒体亚基2突变蛋白的核苷酸序列,与人的动力蛋白样120kDa蛋白,线粒体亚基2正常蛋白的核苷酸序列的比对结果来确定,并根据如下探针的设计原则,设计出针对人的动力蛋白样120kDa蛋白,线粒体亚基2突变蛋白的特异性的核苷酸探针。

  其中,核苷酸探针设计的原则如下:

  ①核苷酸探针Tm值应接近整个基因组的平均Tm值,上下波动5℃;

  ②核苷酸探针分子内重复的单一碱基连续不超过4个;

  ③G+C含量为40%-60%,减少非特异性杂交保证杂交的特异性;

  ④核苷酸探针序列中与探针分子内部稳定二级结构配对的碱基长度应少于4bp,这样可以保证不会因核苷酸探针内部稳定的二级结构而影响杂交效率;

  ⑤经同源比较与其他序列的相似性小于40%;

  ⑥经对比与非探针备选序列的同源片段连续不超过20个碱基。

  其中,人的动力蛋白样120kDa蛋白,线粒体亚基2突变蛋白对应的氨基酸序列与人的动力蛋白样120kDa蛋白,线粒体亚基2正常蛋白对应的氨基酸序列的比对结果请参考图1,其中,图1中的Query序列是人的动力蛋白样120kDa蛋白,线粒体亚基2突变蛋白对应的氨基酸序列,Sbjct序列是人的动力蛋白样120kDa蛋白,线粒体亚基2正常蛋白对应的氨基酸序列,Query序列与Sbjct序列之间的序列为比对结果,根据图1可知,人的动力蛋白样120kDa蛋白,线粒体亚基2突变蛋白相对于人的动力蛋白样120kDa蛋白,线粒体亚基2正常蛋白,有一处氨基酸序列发生了突变,并有一处存在缺失。根据SEQ ID NO:2所示的核苷酸序列,以及图1的比对结果,为了能够特异性识别待检测对象的动力蛋白样120kDa蛋白,线粒体亚基2是否发生了突变,那么在选取核苷酸探针时,可以按照如下几种方式中的任一种方式设计核苷酸探针:

  ①将包含有突变位置核苷酸的一条核苷酸序列作为核苷酸探针。

  ②在缺失位置之前与在缺失位置之后各选择若干个核苷酸序列(碱基序列的顺序不变),生成核苷酸探针。

  在本实施例中,根据SEQ ID NO:2所示的核苷酸序列以及根据上述核苷酸探针设计原则,按照上述方式至少可以设计出如下几种优选地核苷酸探针:

  如SEQ ID NO:3所示的核苷酸探针为:agtgaggtct;

  如SEQ ID NO:4所示的核苷酸探针为:gaagaaacgg cgtt;

  如SEQ ID NO:5所示的核苷酸探针为:ccggaagaaa cggcgtttag。

  (2)核苷酸探针的合成:通过核苷酸序列合成上述设计好的核苷酸探针。

  2、检测人的动力蛋白样120kDa蛋白,线粒体亚基2是否发生突变的基因芯片的制备

  为了保证检测对象样品的质量,还需在基因芯片上设计空白对照、阳性对照和阴性对照。其中,该基因芯片的布局至少可以为如图2所示的一种布局。在图2中,□为空白对照,○为阴性对照,为阳性对照,为实验组。

  其中,实验组的位置即为核苷酸探针的点样位置。

  对于空白对照、阴性对照所需点样的阴性内参质控探针、以及阳性对照所需点样的阳性内参质控探针设计如下:

  空白对照:是不含任何基因片段的空白点样液作为芯片制备过程中的污染监控指标。

  阴性内参质控探针:是一段与检测基因没有同源性的其他基因片段,作为杂交过程中非特异性杂交的监控指标,阴性内参质控探针包括的核苷酸个数可以与核苷酸探针的碱基个数相同,也可以不同。本发明实施例中,基因芯片所需的阴性内参探针序列可以为:tgatgctgat aattgcat。

  阳性内参质控探针:是一段与检测基因有同源性的其他基因片段,在人的动力蛋白样120kDa蛋白,线粒体亚基2突变蛋白中,选择与核苷酸探针对应的序列不同,且可以与核苷酸探针碱基的个数相同,也可以与核苷酸探针碱基的个数不同的一段核苷酸序列作为阳性内参质控探针。优选地,选取核苷酸个数与核苷酸探针碱基的个数相同的阳性内参质控探针。本发明实施例中,基因芯片所需的阳性内参探针序列可以为:atctggtttc acga。

  需要说明的是,在基因芯片的点样过程中,按照基因芯片的布局点入阴性内参探针和阳性内参探针溶液;空白对照所用的试剂为1倍的点样缓冲液(10%海藻糖溶液)。

  实施例二、基因芯片的应用

  1、样品处理

  (1)采集检测对象的血液1-3mL。

  (2)取DEPC处理的1.5mL EP管,将其作为被检测样品处理管,在被检测样品处理管中加入检测对象的血液300μL,再加入Trizol 700μL,充分混匀,室温放置10min。

  (3)加入140μL的氯仿,盖紧管盖,用力震荡,室温放置3-5min,置于离心机中,12000r/min,4℃离心15min,小心吸取离心管中上清,将吸取的上清转移到干净的离心管中。

  (4)在储存有步骤(3)中上清的离心管中加入等体积异丙醇,轻轻颠倒离心管充分混匀液体,室温放置10min,12000r/min,4℃离心15min,小心吸去所有上清。

  (5)用1mL 75%的乙醇清洗一次,7500r/min,4℃离心15min,小心吸去所有上清,在超净台中干燥15min,加入10μLDEPC处理水溶解。

  (6)所得产物为RNA,如果总RNA的纯度不高,会影响探针的标记效率和芯片杂交结果。所以使用QIAGENKit纯化总RNA。

  2、cDNA第一链和第二链一步法合成

  (1)取2μg RNA于1.5mL的离心管中配置如下反应溶液:

  

  其中,RNase-free Water的加入量XμL,是根据总体积11.5μL减去T7Promotor primer的加入量5μL,再减去总RNA的加入量计算得来的。

  (2)在65℃下保温10min,并冰浴5min,将5×First StrandBμffer在65℃下预热5min。

  (3)配置如下cDNA合成体系:

  (4)将上述8.5μL混合均匀后加入变性后冰浴的RNA中。

  (5)用枪头混匀之后离心。

  (6)40℃反应2h。

  3、aaUTP标记cRNA合成

  NTP的配置:

  

  分装成10管备用,注:50%PEG(聚乙二醇)使用之前40℃保温1min。同时按如下操作配置Transcription mix;

  (1)配置Transcription mix

  

  (2)加入60μL Transcription mix并混匀。

  (3)PCR仪中热盖60℃,40℃反应2h。

  4、cRNA纯化

  QIAGEN RNeasy Mini kit纯化cRNA,具体方法可参见QIAGEN公司随试剂盒提供的操作手册。

  (1)加入20μL RNase free水,加入350μL Buffer RLT并充分混匀。

  (2)加入250μL无水乙醇,Tip头充分混匀。

  (3)将共计700μL含总RNA的溶液转入套在2mL离心管内的RNeasy柱子内≥8000g离心15-30s,弃去滤过液。

  (4)吸取500μL Buffer RPE到RNeasy mini柱子内≥8000g离心洗涤15-30s弃去滤过液再用500μL Buffer RPE在≥8000g离心洗涤2min弃去滤过液和2mL的套管将RNeasy mini柱子转入一新的1.5mL Eppendorf管中。

  (5)吸取30μLRNase free的水静置1min,≥8000g离心洗脱1min。

  (6)重复步骤(5)一次。

  5、cRNA浓度测定

  用分光光度计分析cRNA浓度。需要测定260nm和280nm处的吸光值来确定样品的浓度和纯度,A260/A280应接近2.0为较纯的cRNA(比值在1.9-2.1也可)。

  6、cRNA样品荧光标记;

  (1)取上述cRNA4μg并浓缩至6.6μL。

  (2)加10μLDMSO混匀。

  (3)加3.4μL的0.3M pH为9.0的碳酸氢钠(NaHCO3)并混匀。

  (4)将上述20μL cRNA混合物加入到荧光染料Cy3中并混匀。25℃保温1h。

  (5)加9μL的4M Hydroxylamine混匀后25℃保温15min。

  7、荧光标记cRNA样品纯化

  具体步骤同本实施例的步骤4中cRNA纯化的过程,本步骤不在赘述。

  8、cRNA样品片段化和芯片杂交4×44K microarrays

  (1)按下表配制片段化混合液然后在60℃温浴30min进行片段化。

  

  (2)加入55μL 2×GEx Hybridization Buffer。

  (3)取100μL杂交液滴加到芯片皿上,同时按芯片布局如图2所示分别滴加在空白、阴性、阳性、实验组位置上。盖上芯片并密封于杂交盒中,60℃滚动杂交16h。

  9、芯片洗涤

  洗液1(1L)配置:

  

  洗液2(1L)配置:

  洗液3:Stabilization andDrying Solution

  (1)取出芯片于洗液1中洗涤1min;

  (2)再将芯片放入洗液2中洗涤1min(37℃);

  (3)最后将芯片于洗液3中洗涤30s。

  10、芯片扫描

  将芯片在扫描仪中进行扫描,根据扫描结果确定检测对象的动力蛋白样120kDa蛋白,线粒体亚基2蛋白是否发生了突变。请参考图3和图4,图3所示的结果中,阴性对照无绿色荧光,阳性对照为绿色荧光,表明采集检测对象的样品质量是没有问题的,而实验组为绿色荧光,那么表明检测对象的动力蛋白样120kDa蛋白,线粒体亚基2蛋白发生了突变。图4所示的结果中,阴性对照为无色荧光,阳性对照为绿色荧光,表明采集检测对象的样品质量是没有问题的,而实验组无绿色荧光,那么表明检测对象的动力蛋白样120kDa蛋白,线粒体亚基2蛋白未发生突变。

  实施例三、特异性识别人的动力蛋白样120kDa蛋白,线粒体亚基2突变蛋白的单克隆抗体的制备

  1、试剂的确定

  该试剂中含有用于检测上述人的动力蛋白样120kDa蛋白,线粒体亚基2突变蛋白的引物对。

  其中,根据人的动力蛋白样120kDa蛋白,线粒体亚基2正常蛋白的ORF(如SEQ ID NO:6所示),可以确定出人的动力蛋白样120kDa蛋白,线粒体亚基2正常蛋白的ORF对应的碱基序列(如SEQ ID NO:7所示)。

  进一步地,可以根据人的动力蛋白样120kDa蛋白,线粒体亚基2突变蛋白的碱基序列(如SEQ ID NO:2所示),以及根据人的人的动力蛋白样120kDa蛋白,线粒体亚基2正常蛋白的ORF对应的碱基序列(如SEQ ID NO:7所示),设计出的引物对包括下述上游引物与下述任一下游引物的组合:上游引物为如SEQ ID NO:8所示的碱基序列;下游引物为如SEQ ID NO:19~NO:40中任一所示的碱基序列;或,设计出的引物对包括下述任一上游引物与下述任一下游引物的组合:上游引物为如SEQ ID NO:8-NO:18所示的碱基序列;下游引物为如SEQ ID NO:29~NO:40中任一所示的碱基序列:

  如SEQ ID NO:8所示:atgtggcgac tacgtcgggc cgctgtggcc

  如SEQ ID NO:9所示:ttaaggacat cctttcagca gttctcttct

  如SEQ ID NO:10所示:ctgacaaacc ttcctttacg taaactgaaa

  如SEQ ID NO:11所示:ttctctccaa ttaaatatgg ctaccagcct

  如SEQ ID NO:12所示:cgcaggaatt tttggccagc aagattagct

  如SEQ ID NO:13所示:acgagactct taaaacttcg ctatctcata

  如SEQ ID NO:14所示:ctaggatcgg ctgttggggg tggctacaca

  如SEQ ID NO:15所示:gccaaaaaga cttttgatca gtggaaagat

  如SEQ ID NO:16所示:atgataccgg accttagtga atataaatgg

  如SEQ ID NO:17所示:attgtgcctg acattgtgtg ggaaattgat

  如SEQ ID NO:18所示:gagtatatcg attttggttc tccggaagaa

  如SEQ ID NO:19所示:acccccaaca gccgatccta gtatgagata

  如SEQ ID NO:20所示:gcgaagtttt aagagtctcg tagctaatct

  如SEQ ID NO:21所示:tgctggccaa aaattcctgc gaggctggta

  如SEQ ID NO:22所示:gccatattta attggagaga atttcagttt

  如SEQ ID NO:23所示:acgtaaagga aggtttgtca gagaagagaa

  如SEQ ID NO:24所示:ctgctgaaag gatgtcctta attggggtcg

  如SEQ ID NO:25所示:ttgaagcttt aaggtaggat gatgtgaatg

  如SEQ ID NO:26所示:ataaatgctt cgtgaaacca gatgtagttt

  如SEQ ID NO:27所示:ttgtagtggt aaacttcctt ttattccaga

  如SEQ ID NO:28所示:gctgtgtttc actaaagact ggcagacctc

  如SEQ ID NO:29所示:agcttgggca atcatttcca acacactagt

  如SEQ ID NO:30所示:ctttccagca ctctgatctc caaccacaac

  如SEQ ID NO:31所示:aacccgtggc agatgatctt gcgtattata

  如SEQ ID NO:32所示:actggcatcataatcagaga gaacatcaag

  如SEQ ID NO:33所示:aacttcagaa tacatgtcaa tcaaagattt

  如SEQ ID NO:34所示:cttaagcttt ctatgatgaa tgcctttgtc

  如SEQ ID NO:35所示:atctttctgc aatactaatt ttctcaattc

  如SEQ ID NO:36所示:tttgttctcc ttttctaatc gttccaagat

  如SEQ ID NO:37所示:tctctgatac ttcaactgag tgtgcagaag

  如SEQ ID NO:38所示:ttcttcctga agttggtcaa ttttctcttt

  如SEQ ID NO:39所示:gtctgacacc tttctaaaat gcttgtcact

  如SEQ ID NO:40所示:ttcagatcca cgatctgttg ctctaaacgc

  在本实施例中,试剂中含有一个用于检测上述人的动力蛋白样120kDa蛋白,线粒体亚基2突变蛋白的引物对。

  针对每一种组合生成的引物对(引物(F)和引物(R)),执行下述PCR扩增步骤。

  2、检测对象的DNA为模板进行PCR扩增

  以检测对象的DNA为模板进行PCR扩增,获得人的动力蛋白样120kDa蛋白,线粒体亚基2突变蛋白基因完整片段,并连接pMD19-T Vector(Takara公司),进行测序。然后由专门的生物公司制备抗体,是一种人源化或嵌合型抗体。其中,制备出的单克隆抗体可与SEQ IDNO:1所示的氨基酸序列特异性结合。将制备的抗体采用ELISA法测定含量。

  实施例四、用于检测人的动力蛋白样120kDa蛋白,线粒体亚基2突变蛋白的抗体的ELISA试剂盒

  本实施例中,ELISA试剂盒的组成为:包被有实施例三所述单克隆抗体的ELISA酶标板、酶标二抗、检测对象的动力蛋白样120kDa蛋白,线粒体亚基2蛋白、样品稀释液、包被缓冲液、ELISA酶标板洗涤液、显色液和终止液。

  其中,上述各个组成的参数至少可以为如下一种参数:

  ELISA酶标板可以为96孔的ELISA酶标;

  酶标二抗可以是稀释的HRP(辣根过氧化物酶)标记的山羊抗人IgG;其中,稀释倍数可以是8000倍。

  包被缓冲液可以是1×PBS,pH:7.4;

  ELISA酶标板洗涤液可以是含0.05%Tween-20的1×PBS溶液;

  显色液可以是3,3’,5,5’-四甲基联苯胺;

  终止液可以是2mol/L的硫酸溶液。

  实施例五

  在本发明实施例中,将神经退行性疾病患者作为检测对象,并利用ELISA试剂盒检测该神经退行性疾病患者的动力蛋白样120kDa蛋白,线粒体亚基2蛋白是否发生了突变,该方法至少可以包括如下一种:

  a、使用所述包被缓冲液将实施例三制备的单克隆抗体进行稀释,例如,稀释成2.0ug/mL,并将稀释后的单克隆抗体加样至ELISA酶标板的孔中,室温孵育1-2h。

  b、使用样品稀释液将神经退行性疾病患者的动力蛋白样120kDa蛋白,线粒体亚基2蛋白稀释成不同浓度梯度,并将不同浓度梯度的动力蛋白样120kDa蛋白,线粒体亚基2蛋白分别加样至ELISA酶标板的孔中,并室温孵育1-2h;

  c、甩去各孔中的液体,加入所述ELISA酶标板洗涤液,洗涤并甩干;

  d、加入所述酶标二抗,并室温孵育1-2h;

  e、甩去各孔中的液体,加入ELISA酶标板洗涤液,洗涤并甩干;

  f、加入所述显色液,室温避光孵育10-20min,加入所述终止液终止反应;

  g、在酶标仪上测定波长为450nm处的吸光值。

  h、制作标准曲线:以标准品浓度为横坐标,标准品测定的吸光值为纵坐标,作出标准曲线;计算标准曲线回归系数R2,当R2>0.99时本次测定有效;其中,可以使用ELISACalc软件绘制该标准曲线,根据该ELISACalc软件可以获知回归系数R2=0.99980,因此,本次测定有效。将检测得到的波长为450nm处的吸光值代入标准曲线即可求得神经退行性疾病患者的动力蛋白样120kDa蛋白,线粒体亚基2蛋白的浓度。利用建立的ELISA方法检测神经退行性疾病患者血清样品中动力蛋白样120kDa蛋白,线粒体亚基2蛋白的含量。并用Western blot进行鉴定。请参考图5,为吸光值的标准曲线。其中,X轴为吸光值,Y轴为对应的浓度。

  i、Western blot鉴定

  1、制胶

  (1)清洗玻璃板并擦干;

  (2)参考分子克隆方法配制SDS-PAGE胶:

  A.下层分离胶配制体系(Total Volum:15mL)

  

  B.上层积层胶浓缩配制体系(Total Volum:8mL)

  

  (3)在每个胶板中加入相应体积的下层分离胶,再加入1mL的无菌ddH2O,压平分离胶,待分离胶凝固后,用滤纸吸干制胶板中剩余的水分,而后加入上层浓缩胶,插入梳子后等待上层浓缩胶凝固。

  2、蛋白上样电泳:

  (1)拔下梳子,做好孔道标记,加入5×SDS电泳缓冲液,随后给蛋白样品中加入SDS-PAGE蛋白上样缓冲液(5×),沸水浴加热3-5min,上样;

  (2)先用80V电压进行电泳,待条带跑过浓缩胶之后,换用100V电压跑大约100min。

  3、转膜及孵育:

  (1)先把PVDF膜在甲醇中活化约30s。分别将凝胶、海绵垫和PVDF膜预先在电转移缓冲液中平衡30min。按滤纸-胶-膜-滤纸的顺序夹好,按照黑面对黑面的原则放入转膜器中,加入制冷器(冰袋),在冰中以150mA的电流跑约120min;

  (2)完成后将膜取出,立刻放入5%的脱脂牛奶中,摇床上轻轻室温封闭1h;

  (3)PBST清洗已封闭的膜,清洗3次,每次10min;

  (4)加入稀释到相应倍数的一抗,4℃摇床过夜孵育;

  (5)回收一抗,PBST清洗膜3次,每次10min;

  (6)二抗(用3%的牛奶以1:5000-1:10000稀释)室温孵育膜2h;

  (7)用PBST清洗膜3次,每次10min;

  (8)Pierce ECLWestern Blotting Substrate试剂盒A、B液等体积混匀后,逐滴滴加在PVDF膜上;

  (9)FluorChem E FE0511中曝光成像,实验用Image J分析。

  其中,一抗是公司制备的人的动力蛋白样120kDa蛋白,线粒体亚基2突变蛋白单克隆抗体,二抗是辣根过氧化物酶标记的山羊抗人IgG。

  j、Western blot检测结果分析:按照Western blot实验步骤显示结果,如图6所示,其中,图6中的Marker用于表征标记蛋白的大小。与空白对照相比,仅在实验组40KD附近出现明显条带,其中,动力蛋白样120kDa蛋白,线粒体亚基2突变蛋白分子量大约为40KD,表明该神经退行性疾病患者的动力蛋白样120kDa蛋白,线粒体亚基2蛋白确实存在突变。

  以上所述仅是本发明的优选实施方式,并不用于限制本发明,应当指出,对于本技术领域的普通技术人员来说,在不脱离本发明技术原理的前提下,还可以做出若干改进和变型,这些改进和变型也应视为本发明的保护范围。

  序列表

  <110> 天津市湖滨盘古基因科学发展有限公司

  <120> 动力蛋白样120kDa蛋白,线粒体亚基2突变及应用

  <160> 40

  <170> SIPOSequenceListing 1.0

  <210> 1

  <211> 161

  <212> PRT

  <213> 智人种(Homo sapiens)

  <400> 1

  Ser Glu Val Cys Gln Ser Leu Val Lys His Ser Ser Gly Ile Lys Gly

  1 5 1015

  Ser Leu Pro Leu Gln Lys Leu His Leu Val Ser Arg Ser Ile Tyr His

  202530

  Ser His His Pro Thr Leu Lys Leu Gln Arg Pro Gln Leu Arg Thr Ser

  354045

  Phe Gln Gln Phe Ser Ser Leu Thr Asn Leu Pro Leu Arg Lys Leu Lys

  505560

  Phe Ser Pro Ile Lys Tyr Gly Tyr Gln Pro Arg Arg Asn Phe Trp Pro

  65707580

  Ala Arg Leu Ala Thr Arg Leu Leu Lys Leu Arg Tyr Leu Ile Leu Gly

  859095

  Ser Ala Val Gly Gly Gly Tyr Thr Ala Lys Lys Thr Phe Asp Gln Trp

  100 105 110

  Lys Asp Met Ile Pro Asp Leu Ser Glu Tyr Lys Trp Ile Val Pro Asp

  115 120 125

  Ile Val Trp Glu Ile Asp Glu Tyr Ile Asp Phe Gly Ser Pro Glu Glu

  130 135 140

  Ala Phe Arg Ala Thr Asp Arg Gly Ser Glu Ser Asp Lys His Phe Arg

  145 150 155 160

  Lys

  <210> 2

  <211> 483

  <212> DNA

  <213> 智人种(Homo sapiens)

  <400> 2

  agtgaggtct gccagtcttt agtgaaacac agctctggaa taaaaggaag tttaccacta 60

  caaaaactac atctggtttc acgaagcatt tatcattcac atcatcctac cttaaagctt 120

  caacgacccc aattaaggac atcctttcag cagttctctt ctctgacaaa ccttccttta 180

  cgtaaactga aattctctcc aattaaatat ggctaccagc ctcgcaggaa tttttggcca 240

  gcaagattag ctacgagact cttaaaactt cgctatctca tactaggatc ggctgttggg 300

  ggtggctaca cagccaaaaa gacttttgat cagtggaaag atatgatacc ggaccttagt 360

  gaatataaat ggattgtgcc tgacattgtg tgggaaattg atgagtatat cgattttggt 420

  tctccggaag aaacggcgtt tagagcaaca gatcgtggat ctgaaagtga caagcatttt 480

  aga 483

  <210> 3

  <211> 10

  <212> DNA

  <213> 人工序列(Artificial Sequence)

  <400> 3

  agtgaggtct 10

  <210> 4

  <211> 14

  <212> DNA

  <213> 人工序列(Artificial Sequence)

  <400> 4

  gaagaaacgg cgtt 14

  <210> 5

  <211> 20

  <212> DNA

  <213> 人工序列(Artificial Sequence)

  <400> 5

  ccggaagaaa cggcgtttag 20

  <210> 6

  <211> 924

  <212> PRT

  <213> 智人种(Homo sapiens)

  <400> 6

  Met Trp Arg Leu Arg Arg Ala Ala Val Ala Cys Glu Val Cys Gln Ser

  1 5 1015

  Leu Val Lys His Ser Ser Gly Ile Lys Gly Ser Leu Pro Leu Gln Lys

  202530

  Leu His Leu Val Ser Arg Ser Ile Tyr His Ser His His Pro Thr Leu

  354045

  Lys Leu Gln Arg Pro Gln Leu Arg Thr Ser Phe Gln Gln Phe Ser Ser

  505560

  Leu Thr Asn Leu Pro Leu Arg Lys Leu Lys Phe Ser Pro Ile Lys Tyr

  65707580

  Gly Tyr Gln Pro Arg Arg Asn Phe Trp Pro Ala Arg Leu Ala Thr Arg

  859095

  Leu Leu Lys Leu Arg Tyr Leu Ile Leu Gly Ser Ala Val Gly Gly Gly

  100 105 110

  Tyr Thr Ala Lys Lys Thr Phe Asp Gln Trp Lys Asp Met Ile Pro Asp

  115 120 125

  Leu Ser Glu Tyr Lys Trp Ile Val Pro Asp Ile Val Trp Glu Ile Asp

  130 135 140

  Glu Tyr Ile Asp Phe Gly Ser Pro Glu Glu Thr Ala Phe Arg Ala Thr

  145 150 155 160

  Asp Arg Gly Ser Glu Ser Asp Lys His Phe Arg Lys Val Ser Asp Lys

  165 170 175

  Glu Lys Ile Asp Gln Leu Gln Glu Glu Leu Leu His Thr Gln Leu Lys

  180 185 190

  Tyr Gln Arg Ile Leu Glu Arg Leu Glu Lys Glu Asn Lys Glu Leu Arg

  195 200 205

  Lys Leu Val Leu Gln Lys Asp Asp Lys Gly Ile His His Arg Lys Leu

  210 215 220

  Lys Lys Ser Leu Ile Asp Met Tyr Ser Glu Val Leu Asp Val Leu Ser

  225 230 235 240

  Asp Tyr Asp Ala Ser Tyr Asn Thr Gln Asp His Leu Pro Arg Val Val

  245 250 255

  Val Val Gly Asp Gln Ser Ala Gly Lys Thr Ser Val Leu Glu Met Ile

  260 265 270

  Ala Gln Ala Arg Ile Phe Pro Arg Gly Ser Gly Glu Met Met Thr Arg

  275 280 285

  Ser Pro Val Lys Val Thr Leu Ser Glu Gly Pro His His Val Ala Leu

  290 295 300

  Phe Lys Asp Ser Ser Arg Glu Phe Asp Leu Thr Lys Glu Glu Asp Leu

  305 310 315 320

  Ala Ala Leu Arg His Glu Ile Glu Leu Arg Met Arg Lys Asn Val Lys

  325 330 335

  Glu Gly Cys Thr Val Ser Pro Glu Thr Ile Ser Leu Asn Val Lys Gly

  340 345 350

  Pro Gly Leu Gln Arg Met Val Leu Val Asp Leu Pro Gly Val Ile Asn

  355 360 365

  Thr Val Thr Ser Gly Met Ala Pro Asp Thr Lys Glu Thr Ile Phe Ser

  370 375 380

  Ile Ser Lys Ala Tyr Met Gln Asn Pro Asn Ala Ile Ile Leu Cys Ile

  385 390 395 400

  Gln Asp Gly Ser Val Asp Ala Glu Arg Ser Ile Val Thr Asp Leu Val

  405 410 415

  Ser Gln Met Asp Pro His Gly Arg Arg Thr Ile Phe Val Leu Thr Lys

  420 425 430

  Val Asp Leu Ala Glu Lys Asn Val Ala Ser Pro Ser Arg Ile Gln Gln

  435 440 445

  Ile Ile Glu Gly Lys Leu Phe Pro Met Lys Ala Leu Gly Tyr Phe Ala

  450 455 460

  Val Val Thr Gly Lys Gly Asn Ser Ser Glu Ser Ile Glu Ala Ile Arg

  465 470 475 480

  Glu Tyr Glu Glu Glu Phe Phe Gln Asn Ser Lys Leu Leu Lys Thr Ser

  485 490 495

  Met Leu Lys Ala His Gln Val Thr Thr Arg Asn Leu Ser Leu Ala Val

  500 505 510

  Ser Asp Cys Phe Trp Lys Met Val Arg Glu Ser Val Glu Gln Gln Ala

  515 520 525

  Asp Ser Phe Lys Ala Thr Arg Phe Asn Leu Glu Thr Glu Trp Lys Asn

  530 535 540

  Asn Tyr Pro Arg Leu Arg Glu Leu Asp Arg Asn Glu Leu Phe Glu Lys

  545 550 555 560

  Ala Lys Asn Glu Ile Leu Asp Glu Val Ile Ser Leu Ser Gln Val Thr

  565 570 575

  Pro Lys His Trp Glu Glu Ile Leu Gln Gln Ser Leu Trp Glu Arg Val

  580 585 590

  Ser Thr His Val Ile Glu Asn Ile Tyr Leu Pro Ala Ala Gln Thr Met

  595 600 605

  Asn Ser Gly Thr Phe Asn Thr Thr Val Asp Ile Lys Leu Lys Gln Trp

  610 615 620

  Thr Asp Lys Gln Leu Pro Asn Lys Ala Val Glu Val Ala Trp Glu Thr

  625 630 635 640

  Leu Gln Glu Glu Phe Ser Arg Phe Met Thr Glu Pro Lys Gly Lys Glu

  645 650 655

  His Asp Asp Ile Phe Asp Lys Leu Lys Glu Ala Val Lys Glu Glu Ser

  660 665 670

  Ile Lys Arg His Lys Trp Asn Asp Phe Ala Glu Asp Ser Leu Arg Val

  675 680 685

  Ile Gln His Asn Ala Leu Glu Asp Arg Ser Ile Ser Asp Lys Gln Gln

  690 695 700

  Trp Asp Ala Ala Ile Tyr Phe Met Glu Glu Ala Leu Gln Ala Arg Leu

  705 710 715 720

  Lys Asp Thr Glu Asn Ala Ile Glu Asn Met Val Gly Pro Asp Trp Lys

  725 730 735

  Lys Arg Trp Leu Tyr Trp Lys Asn Arg Thr Gln Glu Gln Cys Val His

  740 745 750

  Asn Glu Thr Lys Asn Glu Leu Glu Lys Met Leu Lys Cys Asn Glu Glu

  755 760 765

  His Pro Ala Tyr Leu Ala Ser Asp Glu Ile Thr Thr Val Arg Lys Asn

  770 775 780

  Leu Glu Ser Arg Gly Val Glu Val Asp Pro Ser Leu Ile Lys Asp Thr

  785 790 795 800

  Trp His Gln Val Tyr Arg Arg His Phe Leu Lys Thr Ala Leu Asn His

  805 810 815

  Cys Asn Leu Cys Arg Arg Gly Phe Tyr Tyr Tyr Gln Arg His Phe Val

  820 825 830

  Asp Ser Glu Leu Glu Cys Asn Asp Val Val Leu Phe Trp Arg Ile Gln

  835 840 845

  Arg Met Leu Ala Ile Thr Ala Asn Thr Leu Arg Gln Gln Leu Thr Asn

  850 855 860

  Thr Glu Val Arg Arg Leu Glu Lys Asn Val Lys Glu Val Leu Glu Asp

  865 870 875 880

  Phe Ala Glu Asp Gly Glu Lys Lys Ile Lys Leu Leu Thr Gly Lys Arg

  885 890 895

  Val Gln Leu Ala Glu Asp Leu Lys Lys Val Arg Glu Ile Gln Glu Lys

  900 905 910

  Leu Asp Ala Phe Ile Glu Ala Leu His Gln Glu Lys

  915 920

  <210> 7

  <211> 2775

  <212> DNA

  <213> 智人种(Homo sapiens)

  <400> 7

  atgtggcgac tacgtcgggc cgctgtggcc tgtgaggtct gccagtcttt agtgaaacac 60

  agctctggaa taaaaggaag tttaccacta caaaaactac atctggtttc acgaagcatt 120

  tatcattcac atcatcctac cttaaagctt caacgacccc aattaaggac atcctttcag 180

  cagttctctt ctctgacaaa ccttccttta cgtaaactga aattctctcc aattaaatat 240

  ggctaccagc ctcgcaggaa tttttggcca gcaagattag ctacgagact cttaaaactt 300

  cgctatctca tactaggatc ggctgttggg ggtggctaca cagccaaaaa gacttttgat 360

  cagtggaaag atatgatacc ggaccttagt gaatataaat ggattgtgcc tgacattgtg 420

  tgggaaattg atgagtatat cgattttggt tctccggaag aaacggcgtt tagagcaaca 480

  gatcgtggat ctgaaagtga caagcatttt agaaaggtgt cagacaaaga gaaaattgac 540

  caacttcagg aagaacttct gcacactcag ttgaagtatc agagaatctt ggaacgatta 600

  gaaaaggaga acaaagaatt gagaaaatta gtattgcaga aagatgacaa aggcattcat 660

  catagaaagc ttaagaaatc tttgattgac atgtattctg aagttcttga tgttctctct 720

  gattatgatg ccagttataa tacgcaagat catctgccac gggttgttgt ggttggagat 780

  cagagtgctg gaaagactag tgtgttggaa atgattgccc aagctcgaat attcccaaga 840

  ggatctgggg agatgatgac acgttctcca gttaaggtga ctctgagtga aggtcctcac 900

  catgtggccc tatttaaaga tagttctcgg gagtttgatc ttaccaaaga agaagatctt 960

  gcagcattaa gacatgaaat agaacttcga atgaggaaaa atgtgaaaga aggctgtacc 1020

  gttagccctg agaccatatc cttaaatgta aaaggccctg gactacagag gatggtgctt 1080

  gttgacttac caggtgtgat taatactgtg acatcaggca tggctcctga cacaaaggaa 1140

  actattttca gtatcagcaa agcttacatg cagaatccta atgccatcat actgtgtatt 1200

  caagatggat ctgtggatgc tgaacgcagt attgttacag acttggtcag tcaaatggac 1260

  cctcatggaa ggagaaccat attcgttttg accaaagtag acctggcaga gaaaaatgta 1320

  gccagtccaa gcaggattca gcagataatt gaaggaaagc tcttcccaat gaaagcttta 1380

  ggttattttg ctgttgtaac aggaaaaggg aacagctctg aaagcattga agctataaga 1440

  gaatatgaag aagagttttt tcagaattca aagctcctaa agacaagcat gctaaaggca 1500

  caccaagtga ctacaagaaa tttaagcctt gcagtatcag actgcttttg gaaaatggta 1560

  cgagagtctg ttgaacaaca ggctgatagt ttcaaagcaa cacgttttaa ccttgaaact 1620

  gaatggaaga ataactatcc tcgcctgcgg gaacttgacc ggaatgaact atttgaaaaa 1680

  gctaaaaatg aaatccttga tgaagttatc agtctgagcc aggttacacc aaaacattgg 1740

  gaggaaatcc ttcaacaatc tttgtgggaa agagtatcaa ctcatgtgat tgaaaacatc 1800

  taccttccag ctgcgcagac catgaattca ggaactttta acaccacagt ggatatcaag 1860

  cttaaacagt ggactgataa acaacttcct aataaagcag tagaggttgc ttgggagacc 1920

  ctacaagaag aattttcccg ctttatgaca gaaccgaaag ggaaagagca tgatgacata 1980

  tttgataaac ttaaagaggc tgttaaggaa gaaagtatta aacgacacaa gtggaatgac 2040

  tttgcggagg acagcttgag ggttattcaa cacaatgctt tggaagaccg atccatatct 2100

  gataaacagc aatgggatgc agctatttat tttatggaag aggctctgca ggctcgtctc 2160

  aaggatactg aaaatgcaat tgaaaacatg gtgggtccag actggaaaaa gaggtggtta 2220

  tactggaaga atcggaccca agaacagtgt gttcacaatg aaaccaagaa tgaattggag 2280

  aagatgttga aatgtaatga ggagcaccca gcttatcttg caagtgatga aataaccaca 2340

  gtccggaaga accttgaatc ccgaggagta gaagtagatc caagcttgat taaggatact 2400

  tggcatcaag tttatagaag acatttttta aaaacagctc taaaccattg taacctttgt 2460

  cgaagaggtt tttattacta ccaaaggcat tttgtagatt ctgagttgga atgcaatgat 2520

  gtggtcttgt tttggcgtat acagcgcatg cttgctatca ccgcaaatac tttaaggcaa 2580

  caacttacaa atactgaagt taggcgatta gagaaaaatg ttaaagaggt attggaagat 2640

  tttgctgaag atggtgagaa gaagattaaa ttgcttactg gtaaacgcgt tcaactggcg 2700

  gaagacctca agaaagttag agaaattcaa gaaaaacttg atgctttcat tgaagctctt 2760

  catcaggaga aataa 2775

  <210> 8

  <211> 30

  <212> DNA

  <213> 人工序列(Artificial Sequence)

  <400> 8

  atgtggcgac tacgtcgggc cgctgtggcc 30

  <210> 9

  <211> 30

  <212> DNA

  <213> 人工序列(Artificial Sequence)

  <400> 9

  ttaaggacat cctttcagca gttctcttct 30

  <210> 10

  <211> 30

  <212> DNA

  <213> 人工序列(Artificial Sequence)

  <400> 10

  ctgacaaacc ttcctttacg taaactgaaa 30

  <210> 11

  <211> 30

  <212> DNA

  <213> 人工序列(Artificial Sequence)

  <400> 11

  ttctctccaa ttaaatatgg ctaccagcct 30

  <210> 12

  <211> 30

  <212> DNA

  <213> 人工序列(Artificial Sequence)

  <400> 12

  cgcaggaatt tttggccagc aagattagct 30

  <210> 13

  <211> 30

  <212> DNA

  <213> 人工序列(Artificial Sequence)

  <400> 13

  acgagactct taaaacttcg ctatctcata 30

  <210> 14

  <211> 30

  <212> DNA

  <213> 人工序列(Artificial Sequence)

  <400> 14

  ctaggatcgg ctgttggggg tggctacaca 30

  <210> 15

  <211> 30

  <212> DNA

  <213> 人工序列(Artificial Sequence)

  <400> 15

  gccaaaaaga cttttgatca gtggaaagat 30

  <210> 16

  <211> 30

  <212> DNA

  <213> 人工序列(Artificial Sequence)

  <400> 16

  atgataccgg accttagtga atataaatgg 30

  <210> 17

  <211> 30

  <212> DNA

  <213> 人工序列(Artificial Sequence)

  <400> 17

  attgtgcctg acattgtgtg ggaaattgat 30

  <210> 18

  <211> 30

  <212> DNA

  <213> 人工序列(Artificial Sequence)

  <400> 18

  gagtatatcg attttggttc tccggaagaa 30

  <210> 19

  <211> 30

  <212> DNA

  <213> 人工序列(Artificial Sequence)

  <400> 19

  acccccaaca gccgatccta gtatgagata 30

  <210> 20

  <211> 30

  <212> DNA

  <213> 人工序列(Artificial Sequence)

  <400> 20

  gcgaagtttt aagagtctcg tagctaatct 30

  <210> 21

  <211> 30

  <212> DNA

  <213> 人工序列(Artificial Sequence)

  <400> 21

  tgctggccaa aaattcctgc gaggctggta 30

  <210> 22

  <211> 30

  <212> DNA

  <213> 人工序列(Artificial Sequence)

  <400> 22

  gccatattta attggagaga atttcagttt 30

  <210> 23

  <211> 30

  <212> DNA

  <213> 人工序列(Artificial Sequence)

  <400> 23

  acgtaaagga aggtttgtca gagaagagaa 30

  <210> 24

  <211> 30

  <212> DNA

  <213> 人工序列(Artificial Sequence)

  <400> 24

  ctgctgaaag gatgtcctta attggggtcg 30

  <210> 25

  <211> 30

  <212> DNA

  <213> 人工序列(Artificial Sequence)

  <400> 25

  ttgaagcttt aaggtaggat gatgtgaatg 30

  <210> 26

  <211> 30

  <212> DNA

  <213> 人工序列(Artificial Sequence)

  <400> 26

  ataaatgctt cgtgaaacca gatgtagttt 30

  <210> 27

  <211> 30

  <212> DNA

  <213> 人工序列(Artificial Sequence)

  <400> 27

  ttgtagtggt aaacttcctt ttattccaga 30

  <210> 28

  <211> 30

  <212> DNA

  <213> 人工序列(Artificial Sequence)

  <400> 28

  gctgtgtttc actaaagact ggcagacctc 30

  <210> 29

  <211> 30

  <212> DNA

  <213> 人工序列(Artificial Sequence)

  <400> 29

  agcttgggca atcatttcca acacactagt 30

  <210> 30

  <211> 30

  <212> DNA

  <213> 人工序列(Artificial Sequence)

  <400> 30

  ctttccagca ctctgatctc caaccacaac 30

  <210> 31

  <211> 30

  <212> DNA

  <213> 人工序列(Artificial Sequence)

  <400> 31

  aacccgtggc agatgatctt gcgtattata 30

  <210> 32

  <211> 30

  <212> DNA

  <213> 人工序列(Artificial Sequence)

  <400> 32

  actggcatca taatcagaga gaacatcaag 30

  <210> 33

  <211> 30

  <212> DNA

  <213> 人工序列(Artificial Sequence)

  <400> 33

  aacttcagaa tacatgtcaa tcaaagattt 30

  <210> 34

  <211> 30

  <212> DNA

  <213> 人工序列(Artificial Sequence)

  <400> 34

  cttaagcttt ctatgatgaa tgcctttgtc 30

  <210> 35

  <211> 30

  <212> DNA

  <213> 人工序列(Artificial Sequence)

  <400> 35

  atctttctgc aatactaatt ttctcaattc 30

  <210> 36

  <211> 30

  <212> DNA

  <213> 人工序列(Artificial Sequence)

  <400> 36

  tttgttctcc ttttctaatc gttccaagat 30

  <210> 37

  <211> 30

  <212> DNA

  <213> 人工序列(Artificial Sequence)

  <400> 37

  tctctgatac ttcaactgag tgtgcagaag 30

  <210> 38

  <211> 30

  <212> DNA

  <213> 人工序列(Artificial Sequence)

  <400> 38

  ttcttcctga agttggtcaa ttttctcttt 30

  <210> 39

  <211> 30

  <212> DNA

  <213> 人工序列(Artificial Sequence)

  <400> 39

  gtctgacacc tttctaaaat gcttgtcact 30

  <210> 40

  <211> 30

  <212> DNA

  <213> 人工序列(Artificial Sequence)

  <400> 40

  ttcagatcca cgatctgttg ctctaaacgc 30

《动力蛋白样120kDa蛋白,线粒体亚基2突变及应用.doc》
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