容器和校准标准板
技术领域
本发明涉及适用于例如生物技术相关行业、生命科学行业和医疗行业的容器和校准标准板。
背景技术
迄今为止，已经提出了用于存储、跟踪和搜索关于生物材料和样品的数据的系统，目的在于使用、组织、存储、跟踪、搜索和分析生物材料和样品，以及自动化这些过程(参见，例如，PTL 1)。
还已提出了被配置以存储或分析生物材料的容器(例如，聚合酶链反应(PCR)板)和被配置以存储、跟踪和搜索关于被分析生物样品的数据的读取器。
在包括存储单元(被配置以存储用于跟踪血液包内容物的信息)的血液包中，难以在形成血液包装容器时将存储单元设置在血液包中，并且需要防止血液包装容器受热。因此，还已提出了允许存储单元可附接和可拆卸的方法(例如，参见PTL 2)。
引用列表
专利文献
[PTL 1]PCT国际申请公开号JP-T-2009-517086的日译文
[PTL 1]日本专利号4204753
发明内容
技术问题
本发明的一个目的是提供容器，其中基材被允许正确地对应于存储单元，该存储单元被配置以存储关于在基材的多个凹陷部分中包含的生物材料的信息。
问题解决方案
作为解决上述问题的手段，本发明的容器包括基材，该基材包括多个凹陷部分；识别单元，该识别单元设置在基材上并被配置以识别基材；和存储单元，该存储单元设置在基材上并且被配置以存储关于多个凹陷部分中包含的生物材料的信息。识别单元和存储单元被允许彼此对应。
发明的有益效果
本发明可提供容器，其中基材被允许正确地对应于存储单元，该存储单元被配置以存储关于基材的多个凹陷部分中包含的生物材料的信息。
附图说明
[图1]图1是示例本发明的容器的实例的示意性立体图。
[图2]图2是示例本发明的容器的另一个实例的示意性立体图。
[图3]图3是示例本发明的容器的另一个实例的示意性立体图。
[图4A]图4A是示例从容器的前表面观察的、本发明的容器的另一个实例的示意性立体图。
[图4B]图4B是示例从容器的后表面观察的、本发明的容器的另一示例的示意性立体图。
[图5]图5是示例本发明的容器的另一个实例的示意性立体图。
[图6]图6是示例本发明的容器的另一个实例的示意性立体图。
[图7]图7是示例本发明的容器的另一个实例的示意性立体图。
[图8]图8是示意性立体图，示例了本发明的容器的实例，该容器包括设置在多个基材上的多个识别单元以及存储单元。
[图9]图9是示例DNA已被复制的细胞的频率与荧光强度之间的关系的实例的图。
具体实施方式
(容器)
本发明的容器，在其第一方面中，包括基材，该基材包括多个凹陷部分；识别单元，该识别单元设置在基材上并被配置以识别基材；和存储单元，该存储单元设置在基材上并且被配置以存储关于多个凹陷部分中包含的生物材料的信息。识别单元和存储单元被允许彼此对应。如果需要，容器还包括其他构件。
本发明的容器，在其第二方面中，包括多个基材，每个基材包括多个凹陷部分；多个识别单元，每个识别单元设置在所述多个基材中的每一个上，并且被配置以识别所述多个基材中的每一个；和存储单元，该存储单元设置在所述多个基材上，并且被配置以存储关于所述多个凹陷部分中包含的生物材料的信息。所述多个识别单元和所述存储单元被允许彼此对应。如果需要，容器还包括其他构件。
本发明的容器基于以下发现：在相关技术中，被配置以识别基材的识别单元不一定被允许正确地对应于存储单元——该存储单元被配置以存储关于基材的凹陷部分中包含的生物材料的信息。
在本发明中，设置在基材上并且被配置以识别基材的识别单元被允许对应于设置在基材上并且被配置以存储关于多个凹陷部分中包含的生物材料的信息的存储单元。因此，通过将基材安装在分析器中并将存储单元安装在读取器中，存储单元可以正确地对应于识别单元。这使得可以安全并且可靠地分析或测试生物材料。即，例如，当本发明的容器用作校准标准板时，基材应正确地对应于关于基材的凹陷部分中包含的生物材料的信息。特别是当大规模生产基材时，不正确的对应可能发生。然而，本发明可以确保防止不正确的对应。当使用本发明的容器作为校准标准板来校准分析器时，可以在个人计算机(PC)上分析校准数据。因此，可以确保防止不正确的对应。
<识别单元>
识别单元是设置在基材上并且被配置以识别基材的单元。
识别单元优选是选自识别部分和识别表示(recognition representation)的至少一种。
识别单元优选是选自条形码、QR码(注册商标)和射频识别器(RFID)的至少一种。其中，当大规模生产基材时，RFID是优选的，因为可以通过无线通信进行对应。当基材被插入分析器中时，RFID也是优选的，因为可以通过无线通信进行对应。
识别单元的数量可以是每个基材一个。可选地，可以根据凹陷部分的数量设置多个识别单元。
当识别单元是无线通信的RFID时，识别单元优选被设置在读取器附近，因为RFID的通信范围在几十米之内。
识别表示优选地是选自字符、符号、图形和颜色的至少一种。其中，编号是特别优选的。识别表示比识别部分更优选，因为识别表示以较低的成本产生，不需要用于读取识别部分的信息的读取器，并且可以目视识别识别表示。
识别单元优选地设置在凹陷部分内侧或凹陷部分外周边缘部分以外的位置。
注意，当如同根据第二方面的容器一样使用多个基材时，多个识别单元——每个识别单元被配置以识别多个基材中的每一个基材——被设置在多个基材中的每一个基材中。
<存储单元>
存储单元是这样的单元：设置在基材上，优选地在基材的测量区域以外的位置，并且被配置以存储关于多个凹陷部分中包含的生物材料的信息。注意，基材的测量区域是指能够容纳测量对象的凹陷(孔)部分(当基材包括多个凹陷部分时，多个凹陷部分之间的区域也被包括在基材的测量区域中)。
存储单元的实例包括存储器和IC芯片。
基材的测量区域以外的位置可以是基材的内部或外部，只要该位置不是进行测量的位置。
存储单元优选地可附接地且可拆卸地设置于基材。关于附接或拆卸存储单元的方法，如果需要，存储单元可以沿着在基材和存储单元之间的边界部分中设置的穿孔与基材分离。因此，当基材被插入分析器中时，存储单元可以与基材分离，然后因而分离的存储单元可以被安装在读取器中以允许存储单元对应于基材。
存储单元优选地通过附接构件被附接到基材。因此，可以防止存储单元丢失。附接构件的示例包括线(threads)和磁体。
关于凹陷部分中包含的生物材料的信息的实例包括分析结果(例如，活性值和发光强度)、生物材料的数量(例如，细胞的数量)、细胞是死是活、特定碱基序列的拷贝数、多个凹陷部分中哪个凹陷部分包含生物材料(即，细胞)、细胞存在于凹陷部分中的位置、细胞类型，测量日期和时间，以及测量者。
在关于生物材料的信息中，生物材料的数量和特定碱基序列的拷贝数是优选的。
关于生物材料的信息优选是生物材料的已知计数数量。
要存储在多个存储单元中的关于生物材料的信息优选是多个凹陷部分中的每一个凹陷部分的生物材料已知计数数量。
生物材料的数量可以通过例如下文描述的液滴分配器和计数器来测量。
用于将被定义为识别单元的识别表示写入基材的方法的实例包括将识别表示直接印刷到基材上的方法和将印有识别表示的封印件(seal)附接于基材上的方法。
用于将识别信息写入被定义为识别单元的识别部分的方法的实例包括手动输入和将信息存储在写入装置中的方法。
用于将关于基材的凹陷部分中包含的生物材料的信息写入存储单元的方法的实例包括手动输入、直接从液滴分配器和计数器写入数据的方法、传输在服务器中存储的数据的方法、以及传输云(Cloud)存储的数据的方法。液滴分配器和计数器是将生物材料分配到基材的凹陷部分并计数基材的凹陷部分中的生物材料数量的装置。其中，直接从液滴分配器和计数器写入数据的方法是优选的。
液滴分配器和计数器中的液滴喷射单元的操作模式没有具体限制，并且可以根据预期目的而适当选择。操作模式的实例包括喷墨头，例如，使用压电元件的压电加压模式、使用加热器的热模式、以及其中液体通过静电吸引而被吸引的静电模式。
关于液滴分配器和计数器，可以参考例如日本专利申请号2016-12260和2016-132021。
被定义为识别单元的识别表示可以被目视读取，或者在基材被安装在分析器中时被分析器的内部读取机构读取。可选地，可以使用分析器的外部读取器。
当基材被安装在分析器中时，被定义为识别单元的识别部分的识别信息可以被分析器的内部读取机构读取。可选地，可以使用分析器的外部读取器。
存储在存储单元中的信息可以被分析器的外部读取器读取，或者在基材被安装在分析器中时被分析器的内部读取机构读取。
当识别单元是识别表示时，通过将与被定义为识别单元的识别表示相同的识别表示存储在存储单元中，识别单元和存储单元被允许彼此对应。识别表示可以通过如下被存储在存储单元中：将识别表示直接印刷到存储单元上或者将印有识别表示的封印件附接于存储单元上。
当识别单元是识别部分时，识别部分的识别信息被存储在存储单元中。识别部分的识别信息通过例如手动输入或用写入装置写入识别信息而被存储在存储单元中。
注意，被定义为识别单元的识别部分的识别信息——该信息在基材被安装在分析器中时被读取——可以与存储在存储单元中的基材的信息进行核对。这使得可以检查识别单元和存储单元是否被彼此正确对应。
-生物材料–
生物材料的实例包括(1)微生物、(2)包括核苷酸作为组分的物质、(3)包括氨基酸作为组分的物质、和(4)细胞。
(1)微生物的实例包括微观生物，例如，细菌，如大肠杆菌(Escherichia coli)、枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)、乳酸细菌和嗜热细菌；原核生物，如蓝细菌；真核生物，如酵母(例如面包酵母和啤酒酵母)、霉菌(例如蓝霉)、藻类(例如绿藻、褐藻和红藻)；病毒(例如逆转录病毒、感冒病毒、腺病毒和诺如病毒)、噬菌体；和原生动物(例如秀丽隐杆线虫(Caenorhabditis elegans))。其中，细菌、酵母、藻类和病毒是优选的，并且酵母是更优选的。这些微生物可以是天然存在的或是利用遗传重组技术产生的。
(2)包括核苷酸作为组分的物质的实例包括核酸——如包括核糖核苷酸作为组分的核糖核酸(RNA)和包括脱氧核糖核苷酸作为组分的脱氧核糖核酸(DNA)、核酸片段、以及核酸或核酸片段的类似物。
这些可以具有任何长度，并且可以是单链或双链的。核酸或核酸片段的实例包括相对短的寡核苷酸或多核苷酸，用作例如引物、探针或小干扰RNA(siRNA)；和长的多核苷酸，如基因(包括mRNA)和质粒。
核酸或核酸片段的类似物的实例包括非核酸组分与核酸或核酸片段连接的那些、核酸或核酸片段被标记试剂如荧光染料和同位素标记的那些(例如，被荧光染料或放射性同位素标记的引物和探针)、以及构成核酸或核酸片段的核苷酸的化学结构被部分修饰的那些(例如，肽核酸)。这些可以是源自生物体的天然产物或天然产物的修饰产物。可选地，这些可以利用遗传重组技术生成或被化学合成。
(3)包括氨基酸作为组分的物质的实例包括包含氨基酸作为组分的肽、包含氨基酸作为组分的蛋白质、或肽和蛋白质的衍生物。构成肽和蛋白质的氨基酸的类型和蛋白质的构象没有具体限制，并且可以根据预期目的适当选择。
蛋白质的实例包括由氨基酸组成的单纯蛋白质、非蛋白质物质与单纯蛋白质结合的缀合蛋白质、以及多个单纯蛋白质和缀合蛋白质作为亚基结合的聚合物质。单纯蛋白质的实例包括白蛋白、球蛋白、醇溶蛋白、谷蛋白、组蛋白、鱼精蛋白和硬蛋白。缀合蛋白质的实例包括色蛋白，如血红蛋白、附接有糖的糖蛋白、附接有脂质的脂蛋白、附接有核酸的核蛋白、附接有磷的磷蛋白、以及附接有金属的金属蛋白。
蛋白质的种类没有具体限制，并且可以根据预期目的适当选择。蛋白质的实例包括：当蛋白质根据分子的形状分类时，纤维状蛋白质(例如，角蛋白、胶原蛋白和丝心蛋白)和球状蛋白质；当蛋白质根据定位分类时，细胞内蛋白质、膜蛋白质、分泌蛋白质和血红蛋白；当蛋白质根据功能分类时，酶蛋白、激素蛋白、受体蛋白、免疫蛋白(例如抗体)和分子量标记蛋白。
蛋白质衍生物的实例包括单纯蛋白质或缀合蛋白质部分水解的那些、单纯蛋白质或缀合蛋白质热凝固的那些(凝固蛋白质)、非蛋白质附接于蛋白质的那些(例如，被荧光染料或同位素标记的蛋白质)、以及氨基酸残基中的侧链的化学结构被修饰的那些。肽的衍生物的实例包括非肽附接于肽的那些(例如，被荧光染料或同位素标记的肽)和氨基酸残基中的侧链的化学结构被修饰的那些。衍生物的具体实例包括通过将抗体与酶化学交联而产生的抗体-酶复合物(例如抗地高辛(DIG)-碱性磷酸酶(AP)结合抗体)和抗体-荧光染料复合物。
这些蛋白质、肽或衍生物可以是源自生物体的天然产物或天然产物的修饰产物。可选地，这些可以利用遗传重组技术生成或被化学合成。其中，可以适当地示例抗体、酶、血红蛋白、分子量标记蛋白、抗体-酶复合物和抗体-荧光染料复合物。
(4)细胞的实例包括源自生物体(动物或植物)的天然细胞、已建立的细胞和包括重组基因的转化细胞。
动物细胞的实例包括常用于遗传重组技术的各种细胞(例如，小鼠成纤维细胞、中国仓鼠卵巢(CHO)细胞和猿猴COS细胞)或上述细胞的转化体。
植物细胞的实例包括常用于遗传重组技术的各种细胞或上述细胞的转化体。
在生物材料中，具有特定碱基序列的细胞和DNA是特别优选的。
<基材>
基材的材料、形状、尺寸和结构没有具体限制，并且可以根据预期目的适当选择。
基材的材料没有具体限制，并且可以根据预期目的适当选择。材料实例包括半导体、陶瓷、金属、玻璃、石英玻璃和塑料。
基材的形状没有具体限制，并且可以根据预期目的适当选择，但优选为片状或板状。
基材的结构没有具体限制，并且可以根据预期目的适当选择。该结构可以是单层或多层的。
设置在基材中的凹陷部分的形状没有具体限制，并且可以根据预期目的适当选择。凹陷部分的形状的实例包括平底、圆底、U形底和V形底。
设置在基材中的凹陷部分的数量是复数，优选两个或更多个，更优选五个或更多个，进一步优选五十个或更多个。具体地，基材适合为多孔板。多孔板的实例包括24孔、48孔、96孔、384孔和1,536孔板。注意，多孔板可以不是板状的，而是偶联孔管(coupled-welltubes)，例如8联管(8-tube strips)。
<其他构件>
其他构件的实例包括被配置以覆盖多个凹陷部分的盖构件或覆盖片材。
在本发明的容器中，基材被允许正确地对应于存储单元，该存储单元被配置以存储关于基材的多个凹陷部分中包含的生物材料的信息。因此，该容器广泛用于例如生物技术相关行业、生命科学行业和医疗行业。例如，该容器适用于PCR板、细胞培养板和校准标准板。
(PCR板)
用于本发明的PCR板包括本发明的容器，并且如果需要，还包括其他构件。
凹陷部分中包含的生物材料优选是具有特定碱基序列的DNA。
在PCR板中，基材确保对应于关于基材的凹陷部分中包含的生物材料的信息。这能够实现安全并且可靠的PCR。注意，可以包括多种类型的特定碱基序列。
(细胞培养板)
用于本发明的细胞培养板包括本发明的容器，并且如果需要，还包含其他构件。
凹陷部分中包含的生物材料优选是细胞。
优选事先计数和已知细胞数。
在细胞培养板中，基材确保对应于关于基材的凹陷部分中包含的生物材料的信息。这能够使细胞被安全并且可靠地培养。注意，可以包括多种细胞类型。
(校准标准板)
本发明的校准标准板包括本发明的容器，并且如果需要，还包括其他构件。
在校准标准板中，基材确保对应于关于基材的凹陷部分中包含的生物材料的信息。这能够使分析器被安全并且可靠地校准。
凹陷部分中包含的生物材料优选是具有特定碱基序列的细胞或DNA。
关于凹陷部分中包含的生物材料的信息的实例包括细胞数和特定碱基序列的拷贝数。注意，可以包括多种细胞类型或多种类型的特定碱基序列。
现在将参考附图详细描述本发明的容器的实施方式。注意，在附图中，相同的组成构件被赋予相同的参考编号，并且可省略重复的描述。此外，下述组成构件的数量、位置和形状不限于下述实施方式中的数量、位置和形状，并且可使用适于本发明实践的数量、位置和形状。
<第一实施方式>
图1是示例本发明的一个示例性容器的示意图。图1中的容器10包括基材1，该基材1包括多个凹陷部分2；识别部分3，该识别部分3设置在基材1上并且被定义为识别单元，该识别单元被配置以识别基材1；和存储单元4，该存储单元4设置在基材1的测量区域以外(外部)的位置，以存储关于多个凹陷部分2中包含的生物材料的信息。
基材1是包括16个凹陷部分2的聚丙烯多孔板。
注意，图1中描述了16孔多孔板，但同样也可以适用于24孔、48孔、96孔或384孔多孔板。
被定义为识别单元的识别部分3允许基材1对应于存储单元4。这使得可以确保基材1和存储单元4之间的对应，该存储单元4被配置以存储关于基材1的凹陷部分2中包含的生物材料的信息。
被定义为识别单元的识别部分3的实例包括条形码、QR码(注册商标)和RFID。其中，当大规模生产基材1时，RFID是优选的，因为可以通过无线通信进行对应。当基材1被插入分析器中时，RFID也是优选的，因为可以通过无线通信进行对应。
多个被定义为识别单元的识别部分3可以根据基材1中设置的凹陷部分2的数量来设置，如图4A所示。多个识别部分3也可以设置在基材1的后表面上，如图4B所示。
将关于生物材料的信息写入存储单元4的方法的实例包括手动输入、直接从液滴分配器和计数器写入数据的方法、传输服务器中存储的数据的方法、以及传输云存储的数据的方法。液滴分配器和计数器是被配置以将生物材料分配到基材1的凹陷部分2并计数基材的凹陷部分2中的生物材料的数量的装置。
通过将定义为识别单元的识别部分3的信息存储在存储单元4中，识别单元和存储单元被允许彼此对应。识别部分3的信息可以通过例如手动输入或自动输入被存储在存储单元4中。
存储单元4可以与基材1分离，如图1所示。可选地，存储单元4可以可附接地和可拆卸地设置于基材1，如图2所示。
关于附接或拆卸存储单元4的方法，如果需要，存储单元4可以沿着基材1和存储单元4之间的边界部分中设置的穿孔8与基材1分离。因此，当基材1被插入分析器中时，存储单元4可以与基材1分离，然后因而分离的存储单元4可以被安装在读取器中以允许基材1对应于存储单元4。
存储单元4可以通过被定义为附接构件5的线附接到基材1，如图3所示。因此，可以防止存储单元4丢失。
线的材料没有具体限制，并且可以根据预期目的适当选择。材料实例包括纤维、树脂和金属。
<第一实施方式的变形例1>
图5是示例根据第一实施方式的变形例1的容器的示意图。在第一实施方式的变形例1中，电子基板用作容器10。在这种情况下，容器10包括识别部分3和存储单元4，识别部分3被配置以识别电子基板中的区域A、B、C和D，存储单元4被配置以存储关于与区域A、B、C对应的生物材料的信息。识别部分3和存储单元4可以被允许彼此对应。
多个识别部分3可以设置在电子基板中的区域A、B、C和D中的每一个中。
注意，在第一实施方式的变形例1中，与已经描述的第一实施方式的构造相同的构造被赋予相同的参考编号，并且省略重复的描述。
<第一实施方式的变形例2>
图6是示例根据第一实施方式的变形例2的容器的示意图。在第一实施方式的变形例2中，被定义为识别单元的识别表示6(例如，编号)设置在基材上，以允许基材1对应于存储单元4。识别表示6(例如，编号)可以被直接印刷在基材1上，或者绘制有识别表示6的封印件可以被附接在基材1的表面上。
由于不需要使用RFID作为被定义为识别单元的识别部分3，这可以实现成本低于第一实施方式中的成本。此外，与第一实施方式相比，不需要被配置以读取被定义为识别单元的识别部分3的信息的读取器，并且可以通过目视观察识别表示6而容易地进行对应。
识别表示6的设置位置没有具体限制，并且可以根据预期目的适当地选择。从易于观察的角度来看，识别表示6优选设置在基材1的上表面上。当多个基材一个堆叠在另一个之上时，识别表示6优选设置在侧表面上。
注意，在第一实施方式的变形例1中，与已经描述的第一实施方式的构造相同的构造被赋予相同的参考编号，并且省略重复的描述。
<第一实施方式的变形例3>
图7是示例根据第一实施方式的变形例3的容器的示意图。第一实施方式的变形例3包括被定义为识别单元的识别部分3和识别表示6的组合。因此，被定义为识别单元的识别部分3和识别表示6的组合可以通过目视观察和数据(无线地)确保对应。即，在第一实施方式的变形例3中，可以仅通过目视观察进行对应，而无需用读取器读取识别表示6。可选地，在第一实施方式的识别部分3的情况下，例如，当基材1被插入分析器中时，即使不能通过目视观察进行对应，也可以通过数据(无线地)进行对应。
注意，在第一实施方式的变形例3中，与已经描述的第一实施方式的构造相同的构造被赋予相同的参考编号，并且省略重复的描述。
<第二实施方式>
图8是示例根据本发明第二实施方式的容器的示意图。根据第二实施方式的容器包括多个基材1，每一个基材1包括多个凹陷部分2；多个识别单元3a、3b……3z，每一个识别单元设置在所述多个基材1中的每一个上，并且被配置以识别多个基材1中的每一个；和存储单元4，该存储单元4设置在多个基材1的测量区域以外的位置，并且被配置以存储关于所述多个凹陷部分2中包含的生物材料的信息。多个识别单元3a、3b……3z和存储单元4被允许彼此对应。
根据图8中的第二实施方式的容器对于每个包括多个识别单元3a、3b……3z的多个基材包括一个存储单元4，其被配置以一起存储多个识别单元。因此，即使多个基材一起被销售，也只需要一个存储单元4，导致成本较低。
注意，在第二实施方式中，与已经描述的第一实施方式的构造相同的构造被赋予相同的参考编号，并且省略重复的描述。
<第三实施方式>
在第一实施方式中已经描述了包括存储有关于生物材料的信息的存储单元的容器，但是现在将描述生物材料是核酸的情况下的实施方式。
根据第三实施方式的容器优选不仅具有关于核酸拷贝数的信息，而且具有关于下文具体描述的“不确定度(uncertainty)”的信息。注意，可以允许可扩增试剂的分子数对应于拷贝数。
关于与容器相关联的拷贝数和拷贝数的不确定度的信息可以不仅被存储在第一实施方式中描述的存储单元中，还可以被存储在诸如云的网络服务器的存储单元中。在第一实施方式中已经描述了容器包括识别单元——该识别单元被允许对应于存储单元——的实施方式。然而，例如，当远程网络服务器本身的存储单元用作存储单元时，可以从服务器获取信息。
识别单元(识别部分)可以设置在容器本身上或作为单独的单元或部分附接到容器。
关于容器与关于具有特定碱基序列的核酸的拷贝数和该拷贝数的不确定度的信息的对应的信息变成可鉴定的。
这允许当使用包含已知拷贝数的具有特定碱基序列的核酸的容器对测定(assays)或分析器校准或者确保准确度时容器与关于拷贝数的信息的对应。
-鉴定单元-
容器优选地包括鉴定单元，该鉴定单元被配置以能够鉴定关于核酸的已知拷贝数和该拷贝数的不确定度的信息。
鉴定单元没有具体限制，并且可以根据预期目的适当选择。鉴定单元的实例包括存储器、IC芯片、条形码、QR码(注册商标)、射频识别器(RFID)、颜色编码和印刷物。
鉴定单元的设置位置和鉴定单元的数量没有具体限制，并且可以根据预期目的适当地选择。
将信息写入鉴定单元的方法没有具体限制，并且可以根据预期目的适当选择。该方法的实例包括手动输入、从液滴形成装置直接写入数据的方法、传输服务器中存储的数据的方法、以及传输云存储的数据的方法。液滴形成装置是被配置以当可扩增试剂被分配到孔中时计数可扩增试剂的数量的装置。
本发明的容器包括基材和至少一个凹陷部分(孔)，具有关于至少一个凹陷部分中包含的具有特定碱基序列的核酸的拷贝数和该核酸的拷贝数的不确定度的信息，并且如果需要，包括单元和进一步其他构件。
术语“不确定度”在ISO/IEC Guide 99：2007[国际计量学词汇-基础和一般概念和相关术语(VIM)(International vocabulary of metrology-Basic and generalconcepts and associated terms(VIM))]中被定义为“与测量结果相关的、表征可合理地被归为被测量(measurand)的数值的离差(dispersion)的参数”。
短语“可合理地被归为被测量的数值”是指被测量的真实数值的候选者。也就是说，不确定度意为关于由于例如用于产生测量对象的操作或设备而导致的测量结果的离差的信息。不确定度越大，对于测量结果预测的离差越大。
不确定度可以是从测量结果获得的标准偏差，或者可以是半置信水平——表示为在预定或更高概率下包括真值的数值宽度。
可以基于测量不确定度表示指南(Guide to the Expression of Uncertaintyin Measurement)(GUM:ISO/IEC Guide98-3)和日本认可机构备注10测试中测量不确定度指南(Japan Accreditation Board Note 10Guidelines for Measurement Uncertaintyin Testing)计算不确定度。
例如，两种方法可适用作计算不确定度的方法，即，利用测量值的统计学的A类评价方法和利用从例如校准证书、制造商的说明书和公布信息获得的关于不确定度的信息的B类评价方法。
通过将获自诸如操作和测量等因素的所有不确定度转化为标准不确定度，可以在相同置信水平上表示不确定度。标准不确定度是指由测量值获得的平均值的离差。
作为用于计算不确定度的方法的实例，例如，提取造成不确定度的因素并且计算各因素的不确定度(标准偏差)。此外，通过平方和方法组合由此计算的各因素的不确定度，以计算组合的标准不确定度。在计算组合的标准不确定度时，由于使用了平方和方法，可以忽略造成不确定度的因素中具有足够小的不确定度的因素。对于不确定度，可以使用变异系数(CV值)，该变异系数通过将组合的标准不确定度除以期望值而获得。
有些因素被认为是造成不确定度的因素。例如，当通过将目的核酸(试剂)引入细胞然后计数和分配细胞来产生板时，造成各孔中目的核酸的数量的不确定度的因素的实例包括细胞中的核酸数量、被配置以将细胞置于板中的单元、细胞被置于板中适当位置的频率、以及通过细胞悬浮液中细胞破裂以向细胞悬浮液中释放可扩增试剂所导致的污染(污染物的掺入)。
根据本发明，提供了容器(测试装置)，其包括特定的核酸并且能够基于包括核酸扩增技术的测试进行对测定和分析器的性能评价。
<制备容器(测试装置)的方法>
现在将描述用于制备容纳具有特定核酸的细胞的容器的方法。
制备本发明的容器的方法包括细胞悬浮液制备步骤、液滴着落步骤、细胞数计算步骤和核酸提取步骤，优选包括不确定度计算步骤——即计算每个上述步骤的不确定度的步骤、输出步骤和记录步骤，并且如果需要，还包括其他步骤。细胞悬浮液制备步骤是制备包含多个具有特定核酸的细胞和溶剂的细胞悬浮液的步骤。液滴着落步骤是将细胞悬浮液作为液滴喷射，以允许液滴相继着落在被定义为容器的板的孔上的步骤。细胞数计算步骤是在喷射液滴之后和在液滴着落在孔上之前通过传感器计数液滴中包含的细胞数的步骤。核酸提取步骤是从孔内的细胞中提取核酸的步骤。
可以计数特定DNA序列的数量，而不是细胞的数量。通常，特定DNA序列的数量可以被认为等于细胞的数量，因为选择特定的DNA序列以使每个细胞包括一个区域，或通过基因重组技术被引入。然而，细胞在细胞周期的特定阶段分裂以复制细胞内的核酸。细胞周期根据细胞的类型而不同，但是可以通过取出预定量的细胞悬浮液并测量多个细胞的细胞周期来计算单个细胞中包含的特定DNA的数量的预期值和不确定度。这可以通过例如通过流式细胞仪观察细胞核被染色的细胞来进行。
术语“不确定度”是指关于因例如用于产生测量对象的操作或设备所导致的测量结果的离差的信息。术语“计算”意为通过计算确定数值。
图9是示例DNA已被复制的细胞的频率与荧光强度之间的关系的实例的图。如图9所示，根据DNA复制是否存在，两个峰出现在直方图中，使得可以计算DNA已被复制的细胞的比率。基于由此计算的结果，可以计算单个细胞中包含的DNA的平均数。该平均数可以乘以如上所述计数的细胞数，以计算核酸的估测数。
优选处理细胞以在产生细胞悬浮液之前控制细胞周期。通过允许细胞处于复制之前或之后的相同阶段，可以以更高的准确度由细胞数计算特定核酸的数量。
优选计算核酸估测数的不确定度。这允许将不确定度表示为方差(variance)或标准偏差并输出。当加和多种因子(因素，factor)的影响时，可以采用经常采用的标准偏差的平方和的平方根。例如，喷射细胞数的正确率(validity)、细胞中的DNA数量和着落在孔内的喷射细胞比率可用作因子。其中，可以选择和计算一些具有显着影响的因子。
<<不确定度计算步骤>>
不确定度计算步骤是计算各步骤如细胞悬浮液制备步骤、液滴着落步骤和细胞数计算步骤中的不确定度的步骤。
可以以与细胞悬浮液制备步骤中相同的方式计算不确定度。
注意，不确定度可以在细胞数计算步骤的下一步骤中一起计算，或者可以在每个步骤如细胞悬浮液制备步骤、液滴着落步骤和细胞数计算步骤结束时计算，并在细胞数计算步骤的下一步骤中组合。换句话说，各步骤中的不确定度可被适当地计算，直到组合。
<<输出步骤>>
输出步骤是以基于用传感器测量的检测结果由粒子数计数单元计数的计数值输出着落在孔内的细胞悬浮液中的细胞数的步骤。
计数值是指根据传感器测量的检测结果由粒子数计数单元计数的、孔中包含的细胞数。输出意为在接收输入时，通过诸如电动机、通信器和计算器的装置将计数值以电子信息发送到被定义为外部计数结果存储单元的服务器，或者将计数值印刷为印刷物。
输出步骤也是向外部存储部分输出观察值或预测值的步骤，所述观察值或预测值是通过在制备板时观察或预测板的各孔中的细胞或核酸数量而获得的。
输出可以在细胞数计算步骤的同时或之后进行。
<<记录步骤>>
记录步骤是在输出步骤时记录观察值或预测值输出的步骤。
记录步骤可以适当地在记录部分进行。
记录可以在输出步骤的同时或之后进行。
记录装置不仅向记录部分提供信息，而且还将信息存储在记录部分中。
然后，为考虑从包括已知数量的细胞的板获得的结果的可靠性，制备已知包括单个细胞的板，并计算单个细胞情况下的不确定度。注意，可以使用下述方法针对具有特定碱基序列的各核酸数计算在各种核酸数情况下的不确定度。
-不确定度的计算-
在本例中，液滴中的细胞数、细胞中目的核酸的数量以及凹陷部分(孔)中目的核酸的污染用作造成不确定度的因素。
作为液滴中的细胞数，采用通过分析从喷射单元喷射的液滴的图像而计数的液滴中的细胞数和针对从喷射单元喷射并着落在载玻片上的每个液滴通过显微观察而计数的细胞数。
利用对应于细胞周期的G1期的细胞比率(99.5％)和对应于G2期的细胞比率(0.5％)，计算细胞(细胞周期)中的目的核酸的数量。
关于孔中的细胞数，计数喷射液滴中着落入孔内的细胞数。然而，这个因素，即孔中的细胞数，被排除在不确定度的计算之外，因为当针对96个样品计数时，所有液滴都着落在孔内。
以下列方式验证污染。将4微升墨水滤液进行实时PCR，以验证细胞中的目的核酸以外的核酸是否在墨水中污染。此程序重复三次。结果是，在所有三个试验中在最小检测限检测到目的核酸以外的核酸。因此，污染也被排除在不确定度计算之外。
组合标准不确定度通过如下确定：确定各因素测量值的标准偏差，将标准偏差乘以灵敏度系数以将标准偏差的单位统一为被测量的单位从而获得标准不确定度，和利用平方和法由标准不确定度确定组合标准不确定度。在组合标准不确定度中，仅包括正态分布中的约68％的值。因此，通过确定扩展不确定度(expanded uncertainty)，即组合标准不确定度的两倍，可以获得考虑正态分布中的约95％的值的不确定度。结果列于下表1的预算表中。
[表1]
在表1中，“符号”表示任何被允许对应于不确定度的因素的符号。
在表1中，“数值(±)”表示平均值的实验标准偏差，即，计算的实验标准偏差除以数据数的平方根值。
在表1中，“概率分布”是指不确定度的因素的概率分布。在A类不确定度评价的情况下，该区域留空。在B类不确定度评价的情况下，该区域填有正态分布或矩形分布。在本例中，仅进行A类不确定度评价，因此概率分布的区域留空。
在表1中，“除数”表示用于标准化得自各因素的不确定度的数值。
在表1中，“标准不确定度”是指通过将“数值(±)”中的值除以“除数”中的值而获得的值。
在表1中，“灵敏度系数”是指用于统一为被测量的单位的值。
对于上述结果，用户可以使用不确定度指数作为实验中各孔的测量结果可靠性的判断标准——通过将各孔的所得扩展不确定度存储为离差指数。可靠性的判断标准的使用能够实现试验的高准确度性能评价。
例如，本发明的方面如下。
<1>容器，包括：
基材，包括多个凹陷部分；
识别单元，设置在基材上并被配置以识别基材；和
存储单元，设置在基材上，并且被配置以存储关于多个凹陷部分中包含的生物材料的信息，
其中识别单元和存储单元被允许彼此对应。
<2>容器，包括：
多个基材，每个基材包括多个凹陷部分；
多个识别单元，每个识别单元设置在多个基材中的每一个基材上，并且被配置以识别多个基材中的每一个基材；和
存储单元，设置在多个基材上，并且被配置以存储关于多个凹陷部分中包含的生物材料的信息，
其中多个识别单元和存储单元被允许彼此对应。
<3>根据<2>的容器，其中多个识别单元被允许对应于一个存储单元。
<4>根据<1>至<3>中任一项的容器，
其中生物材料包括细胞。
<5>根据<4>的容器，其中生物材料包括具有特定碱基序列的DNA。
<6>根据<5>的容器，其中要存储在存储单元中的关于生物材料的信息是特定碱基序列的拷贝数。
<7>根据<4>或<5>的容器，
其中多个凹陷部分中包含的生物材料的数量是生物材料的已知计数数量。
<8>根据<7>的容器，
其中要存储在存储单元中的关于生物材料的信息是多个凹陷部分中的每一个凹陷部分的生物材料的已知计数数量。
<9>根据<1>至<8>中任一项的容器，
其中识别单元是选自识别部分和识别表示的至少一种。
<10>根据<9>的容器，
其中基材包括识别部分和识别表示，并且
其中识别部分和识别表示被允许对应于存储单元。
<11>根据<9>或<10>的容器，其中识别部分是选自条形码、QR码(注册商标)和RFID的至少一种。
<12>根据<9>至<11>中任一项的容器，
其中识别表示是选自字符、符号、图形和颜色的至少一种。
<13>根据<12>的容器，其中识别表示包括编号。
<14>根据<1>至<13>中任一项的容器，
其中识别单元设置在多个凹陷部分的内侧或多个凹陷部分的外周边缘部分以外的位置。
<15>根据<1>至<14>中任一项的容器，
其中识别单元设置在多个凹陷部分中的每个凹陷部分中。
<16>根据<1>至<15>中任一项的容器，
其中识别单元设置在基材的多个位置中。
<17>根据<1>至<16>中任一项的容器，
其中存储单元被可附接并且可拆卸地设置于基材。
<18>根据<1>至<17>中任一项的容器，
其中存储单元被利用附接构件附接到基材。
<19>根据<18>的容器，
其中附接构件包括线。
<20>PCR板，包括
根据<1>至<19>中任一项的容器。
<21>细胞培养板，包括
根据<1>至<19>中任一项的容器。
<22>校准标准板，包括
根据<1>至<19>中任一项的容器。
<23>容器，包括
已知拷贝数的具有特定碱基序列的核酸，
其中核酸的拷贝数与关于核酸拷贝数的不确定度的信息相关。
<24>容器，包括：
基材，包括多个凹陷部分；和
存储单元，设置在基材上并被配置以存储关于多个凹陷部分中包含的生物材料的信息，
其中生物材料包括具有特定碱基序列的核酸，并且
其中关于生物材料的信息包括关于核酸拷贝数和核酸拷贝数的不确定度的信息。
<25>根据<23>或<24>的容器，
其中关于已知拷贝数的不确定度的信息是选自下列的至少一种：被配置以将包括核酸的细胞置于容器中的单元、细胞的细胞周期、被置于容器的凹陷部分中的细胞数、和容器的凹陷部分中的目的核酸的污染。
<26>利用根据<23>至<25>中任一项的容器校准分析器的方法。
根据<1>至<19>和<23>至<25>中任一项的容器、根据<20>的PCR板、根据<21>的细胞培养板、和根据<22>的校准标准板、以及根据<26>的校准分析器的方法可以解决上述现有的问题并且可以实现本发明的目的。
参考符号列表
1:基材
2：凹陷部分
3：识别单元(识别部分)
4：存储单元
5：附接构件
6：识别单元(识别表示)
8：穿孔
10：容器
